國家司法機關是行使司法權的國家機關，是國家機構的基本組成部分，是依法成立的行使相關國家職權的司法組織。包括法院、檢察院及有關功能部門。

在中國，司法機關指人民法院、人民檢察院兩大類。另外，公安機關可以被認為是司法機關的一部分，在行使行政職能時則不屬于司法機關；國家安全機關、監獄偵查部門、軍隊保衛部門等其他負有刑事偵查權的機關在進行刑事訴訟的過程中其角色同公安機關。

法院、檢察院獨立行使職權，不受行政機關、社會團體和個人的干涉。

注意：法院、檢察院要受到黨的領導和人大的監督，并接受公眾、新聞媒體等的監督。

(2)獨立行使審判權、檢察權的主體是人民法院、人民檢察院，而不是某個審判員或檢察員個人獨立行使審判權、檢察權，強調的是整體獨立，而不是個體獨立。

(3)獨立行使審判權和檢察權都必須嚴格遵守憲法和法律的各項規定。

二、人民法院獨立行使審判權與人民檢察院獨立行使檢察權的區別

人民法院和人民檢察院在上下級關系上有所不同，因此，二者在行使的獨立程度上也有所不同。人民檢察院上下級之間是領導與被領導的關系，上級人民檢察院有權就具體案件對下級人民檢察院作出命令或指示。而人民法院上下級之間是監督與被監督的關系，各個具體法院在具體案件的審判過程中獨立行使審判權，包括上級人民法院在內的其他人民法院均無權干涉。

(1)以事實為根據、以法律為準繩的原則； 　　(2)公民在適用法律上一律平等的原則； 　　(3)司法機關依法獨立行使職權的原則； 　　(4)專門機關工作與群眾路線相結合的原則； 　　(5)實事求是、有錯必糾和國家賠償原則。

我國的司法原則包括：　

1．司法公正　

2．公民在法律面前一律平等3．以事實為根據，以法律為準繩4．司法機關依法獨立行使職權

指參與司法活動的各個國家機關應分工負責，依法獨立行使各自的職權；司法機關依法、行使檢察權、審理、裁判案件，不受任何行政機關、組織和個人干涉；司法機關作為一個組織整體，集體對審判權、檢察權的行使負責。

司法機關依法獨立行使職權”原則...

指參與司法活動的各個國家機關應分工負責，依法獨立行使各自的職權；司法機關依法、行使檢察權、審理、裁判案件，不受任何行政機關、組織和個人干涉；司法機關作為一個組織整體，集體對審判權、檢察權的行使負責。司法機關依法獨立行使職權”原則的基本涵義有三：(1)司法權的專屬性，即并非所有國家機關均有權行使司法權，除國家各級審判機關和檢察機關外，其他任何機關，團體和個人都無權行使該項權力；(2)行使職權的獨立性，即人民法院、人民檢察院依照法律行使自己的職權，不受任何機關、團體和個人以任何形式的干預；(3)行使職權的合法性，司法機關及其工作人員在適用法律時必須嚴格按照法律規定，正確適用法律，不得濫用職權，枉法裁判。