員工違反競業(yè)限制協(xié)議應當支付的經(jīng)濟補償金按協(xié)議約定辦理。根據(jù)《勞動合同法》第二十三條、二十四條規(guī)定，用人單位可以與高級管理人員、高級技術人員和其它負有保密義務的人員，在勞動合同或者保密協(xié)議中約定保密事項，并約定在解除或者終止勞動合同后，在競業(yè)限制期限內(nèi)，不得到與本單位生產(chǎn)或者經(jīng)營同類產(chǎn)品、從事同類業(yè)務的有競爭關系的其他用人單位，或者自己開業(yè)生產(chǎn)或者經(jīng)營同類產(chǎn)品、從事同類業(yè)務，由用人單位按月給予勞動者經(jīng)濟補償。勞動者違反競業(yè)限制約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。　　競業(yè)限制區(qū)域、期限、經(jīng)濟補償和違約金數(shù)額由用人單位和勞動者約定，但禁業(yè)限制期限不得超過兩年。競業(yè)限制沒有約定的，違約金一般按實際造成的損失支付；也有的地區(qū)采用經(jīng)濟補償金的3倍支付。《勞動合同法》第二十三條　用人單位與勞動者可以在勞動合同中約定保守用人單位的商業(yè)秘密和與知識產(chǎn)權(quán)相關的保密事項。對負有保密義務的勞動者，用人單位可以在勞動合同或者保密協(xié)議中與勞動者約定競業(yè)限制條款，并約定在解除或者終止勞動合同后，在競業(yè)限制期限內(nèi)按月給予勞動者經(jīng)濟補償。勞動者違反競業(yè)限制約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。第二十四條　競業(yè)限制的人員限于用人單位的高級管理人員、高級技術人員和其他負有保密義務的人員。競業(yè)限制的范圍、地域、期限由用人單位與勞動者約定，競業(yè)限制的約定不得違反法律、法規(guī)的規(guī)定。在解除或者終止勞動合同后，前款規(guī)定的人員到與本單位生產(chǎn)或者經(jīng)營同類產(chǎn)品、從事同類業(yè)務的有競爭關系的其他用人單位，或者自己開業(yè)生產(chǎn)或者經(jīng)營同類產(chǎn)品、從事同類業(yè)務的競業(yè)限制期限，不得超過二年。

依據(jù)我國勞動法規(guī)定：“用人單位招用尚未解除勞動合同的勞動者，對用人單位造成經(jīng)濟損失的，該用人單位當依法承擔連帶賠償責任”。

勞動者離職之后違反競業(yè)禁止協(xié)議，新用人單位的責任區(qū)分三種情況：(一)勞動者僅違反競業(yè)禁止約定，新用人單位如果不知道勞動者與原單位簽訂有競業(yè)禁止協(xié)議的，新用人單位因無過錯不應承擔競業(yè)禁止責任。(二)新用人單位若應知或明知勞動者與原用人單位簽有競業(yè)禁止協(xié)議而仍然與勞動者建立勞動關系的，新用人單位應當承擔有關競業(yè)禁止的連帶責任。(三)勞動者因違反競業(yè)禁止約定侵犯原用人單位商業(yè)秘密的情況。這種情況新用人單位不論是否知道勞動者違反了與原單位的競業(yè)禁止約定，都已經(jīng)構(gòu)成了侵權(quán)，新用人單位和勞動者應連帶承擔包括競業(yè)禁止責任在內(nèi)的侵權(quán)責任。

要看競業(yè)協(xié)議上怎么約定的，一般會約定員工要賠償全年薪資的多少多少倍。目的就是為了警告員工不要違反竟也協(xié)議。

用人單位與勞動者簽訂勞動合同時，常常也會要求勞動者簽訂競業(yè)限制協(xié)議，這是為了保護用人單位商業(yè)秘密的需要，如果違反了競業(yè)限制協(xié)議會如何處理呢?這個問題分勞動者違反競業(yè)限制約定和用人單位違反競業(yè)限制約定兩種情況來講。

第一種情況，用人單位違反競業(yè)限制約定，那么勞動者可以提起勞動仲裁，要求用人單位支付經(jīng)濟補償金;因用人單位的原因?qū)е氯齻€月未支付經(jīng)濟補償，勞動者還可以請求解除競業(yè)限制約定。第二種情況，勞動者違反競業(yè)限制約定，那么用人單位可以提起勞動仲裁，要求勞動者按照競業(yè)限制協(xié)議約的標準定支付違約金;同時，用人單位可以要求勞動者按照約定繼續(xù)履行競業(yè)限制義務。如果用人單位與勞動者沒有就勞動者違反競業(yè)限制約定違約金，用人單位可以依據(jù)《勞動合同法》第90條規(guī)定，要求勞動者承擔賠償責任。法律依據(jù)《中華人民共和國勞動合同法》第二十五條除本法第二十二條和第二十三條規(guī)定的情形外，用人單位不得與勞動者約定由勞動者承擔違約金。《中華人民共和國勞動合同法》第九十條勞動者違反本法規(guī)定解除勞動合同，或者違反勞動合同中約定的保密義務或者競業(yè)限制，給用人單位造成損失的，應當承擔賠償責任。