根據國家稅務總局公告2017年第11號《國家稅務總局關于進一步明確營改增有關征管問題的公告》

二、建筑企業與發包方簽訂建筑合同后，以內部授權或者三方協議等方式，授權集團內其他納稅人（以下稱“第三方”）為發包方提供建筑服務，并由第三方直接與發包方結算工程款的，由第三方繳納增值稅并向發包方開具增值稅發票，與發包方簽訂建筑合同的建筑企業不繳納增值稅。發包方可憑實際提供建筑服務的納稅人開具的增值稅專用發票抵扣進項稅額。

當然不可以了，如果總公司跟分公司不在同一個地區，總公司開票對分公司所在稅收來說就流失了，肯定是不允許的。

是的 ，這是可以的。然后總分機構自己做內部抵消即可。合并報表的時候就會抵消了。但是不能做收入和稅金。應該做與總公司的往來。由于是總公司開票，所以總公司做收入，但是總公司么有收到現金，借方需要掛與分公司的往來。月末合并財務報表的時候，總分公司之間的往來賬務抵消，銀行存款和收入業務合并。最后變成你現在寫的這種分錄結果。

白日依山盡，黃河入海流。

烽火連三月，家書抵萬金。

亂花漸欲迷人眼，淺草才能沒馬蹄。

欲說還休，卻道天涼好個秋。

分公司是沒有獨立法人的，子公司有獨立法人，到要看甲方的意思，甲方同意開票就行，但一般不會同意。這涉及到違法轉包。